Hola, Loreto:

este trayecto lo gestiona la Deutsche Bahn, que es la compañía alemana de ferrocarriles. Confiable o no, es la que hay. Puedes consultar los horarios y tarifas en su página web www.bahn.com. Tiene una versión en español bastante aceptable, aunque es más completa la versión alemana, si hablas el idioma.

Básicamente, encontrarás dos tipos de trenes: los trenes rápidos (tipo Intercity: ICE, EC, etc) que son rápidos pero más caros y conviene reservar billete para asegurarse precios más económicos; y los trenes regionales (RegioBahn, RB, RE, etc.) que son más lentos y hacen muchas paradas, pero también suelen ser más económicos y no es necesario reservar (los precios suelen ser fijos).

Respecto al horario, lo que te resulte más cómodo: personalmente, no me gusta llegar demasiado tarde a una ciudad que no conozco y tener que ponerme a localizar mi alojamiento, pero eso son gustos de cada cual.

También hay autobuses que hacen este recorrido y generalmente son más económicos, pero ahí sí que tienes que reservar porque las plazas son más limitadas. Puedes consultar Eurolines o Flixbus.

Un saludo.