Hay lugares como el Cenaccolo Vinciano, que requiere de antelación de meses para poder entrar, pruébalo tu misma, verás la disponibilidad, para el resto yo los he comprado siempre en el mismo día.
En cuanto al transporte hay un pase de 10 viajes, donde ahorras mas o menos el 10% a si comprases el billete suelto así que es mas por comodidad que por el ahorro económico.
Si te alojas centrica el centro se visita bien a pie. Si vas ahora con buen tiempo no te pierdas el lago de Como, fácilmente accesible y económico con el tren de cercanías.
Saludos